在后基因组时代，蛋白质组学已成为深入解析疾病发生机制、发现生物标志物、优化治疗决策的重要工具。质谱技术凭借其高通量、无标记、动态范围广等优势，在临床研究中展现出巨大潜力。其中，DIA（Data-Independent Acquisition，数据非依赖采集）作为新一代质谱采集模式，因其卓越的数据重现性和更全面的蛋白覆盖能力，成为临床蛋白质组学的核心技术之一。

一、DIA技术概述：重构质谱数据获取模式

DIA是一种系统性并行采集策略，质谱仪在扫描过程中不再依赖于信号强度选择前体离子，而是将整个质谱窗口划分为若干等宽子区，在每个子区中同时碎裂所有离子，并获取MS2数据。通过这种方式，DIA实现了对所有可离子化物质的全面监测，极大提升了低丰度蛋白的检测能力与整体采集一致性。

📌DIA具有以下核心优势：

• 数据完整性高：采集范围覆盖所有离子，显著减少数据缺失；
• 重复性强：不依赖实时信号强度，样本间一致性好，适用于大队列分析；
• 定量准确：在无需内标的前提下，也能实现较高精度的蛋白定量；
• 可回溯性强：通过构建光谱库，可在后期重解析数据，开展目标蛋白的追溯分析。

这些特性使得DIA成为面对临床样本异质性、低表达蛋白富集、队列规模庞大等挑战时的优选策略。

二、DIA在临床研究中的关键应用方向

1、疾病分型与亚型识别

现代医学已从“单一诊断”向“分子分型”过渡。通过DIA获取的高通量蛋白表达数据，可帮助研究者识别不同临床表型之间的分子差异，建立蛋白质组学特征图谱，推动疾病亚型的重新定义。这对于理解疾病异质性、制定个体化治疗方案具有重要价值。

2、生物标志物筛选与验证

蛋白质是临床检测最直接的分子实体。DIA凭借其低缺失率和定量一致性，尤其适合在血清、血浆、尿液等体液样本中寻找疾病相关的候选标志物。结合生物信息学分析和统计模型，研究者可基于DIA数据筛选出具有潜在临床意义的诊断或预后因子。

3、药物机制解析与疗效评估

在新药开发或现有治疗方案优化过程中，理解药物作用通路及其下游影响是关键步骤。DIA技术可用于观察治疗前后蛋白表达的全景变化，识别药物响应相关蛋白，进而揭示作用机制、预测疗效或评估毒性风险，为临床干预提供分子级证据。

4、耐药机制与动态监测

临床治疗中的获得性耐药问题，是影响长期疗效的关键障碍。DIA可用于对照敏感与耐药样本的蛋白质组变化，识别关键调控因子，辅助构建耐药通路网络。同时，其高度一致的数据结构也使其适合用于多时点的动态监测，追踪蛋白表达随治疗进程的变化趋势。

5、手术后复发预测与风险建模

术后复发是多种疾病管理中的难点。通过DIA技术对术后组织或体液样本进行定量分析，可以构建蛋白质表达的风险评分模型，用于辅助预测患者复发风险或预后倾向。DIA可提供多维度、多通路的综合信息，提升预测模型的准确性与实用性。

三、技术发展趋势与数据整合潜力

DIA不仅是一个采集技术的革新，更代表了蛋白质组学向临床可用性迈进的关键一步。随着质谱硬件性能的提升、光谱库建设的完善以及数据分析算法的不断进化，DIA的实际应用门槛已大幅降低。DIA-NN、Spectronaut、OpenSWATH等先进软件工具的出现，极大加速了数据处理效率和结果可靠性。此外，DIA数据的标准化和结构化特性，使其天然适合与其他“组学”数据（如转录组、代谢组、表观组）进行多维整合分析。通过机器学习等方法建模，可以在更大范围内识别疾病生物特征，实现精准的临床分型、治疗响应预测和个性化干预路径的构建。

DIA定量蛋白质组学凭借其系统性、高重复性和强定量性能，已成为临床研究中不可替代的技术平台。从疾病分型、标志物发现，到治疗响应与预后评估，DIA正在不断拓展其应用边界，为精准医学注入新动能。如需了解更多DIA蛋白质组技术在临床科研中的应用实践，欢迎关注百泰派克生物科技，我们致力于提供优质的DIA定量蛋白质组学服务，助力全球生命科学研究迈向精准与高效的新阶段。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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